Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMCO1Q147U7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO1Q147U7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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