Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSPNQ14714 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSPNQ14714 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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