Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFTN1Q14699 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN1Q14699 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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