Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1CQ14123 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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