Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCINQ13939 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCINQ13939 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCINQ13939 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCINQ13939 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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CCINQ13939 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CCINQ13939 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CCINQ13939 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CCINQ13939 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCINQ13939 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CCINQ13939 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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