Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHROOM2Q13796 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
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