Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEUROD1Q13562 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
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