Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
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