Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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C1orf61Q13536 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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C1orf61Q13536 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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C1orf61Q13536 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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