Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF4BQ13523 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms