Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRSQ13332 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PTPRSQ13332 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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