Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC3Q13217 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms