Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP4Q13115 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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