Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN2Q12907 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN2Q12907 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN2Q12907 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMAN2Q12907 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
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