Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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CNTN1Q12860 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNTN1Q12860 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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CNTN1Q12860 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNTN1Q12860 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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