Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STX4Q12846 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STX4Q12846 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
STX4Q12846 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STX4Q12846 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STX4Q12846 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STX4Q12846 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STX4Q12846 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STX4Q12846 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms