Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 RTT105YER104W 627 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YHR212CYHR212C 336 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YIL141WYIL141W 390 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 CPR7YJR032W 1182 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YAR060CYAR060C 336 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YAR069CYAR069C 294 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PRM6YML047C 1059 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YOR387CYOR387C 621 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 SRL4YPL033C 846 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 snR189snR189 189 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 REC8YPR007C 2043 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 TSC11YER093C 4293 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MYO5YMR109W 3660 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 KIN82YCR091W 2163 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 KRE2YDR483W 1329 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 ERG11YHR007C 1593 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 ERT1YBR239C 1590 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 TPK3YKL166C 1197 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RPC37YKR025W 849 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RPL15AYLR029C 615 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 GOT1YMR292W 417 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MPD2YOL088C 834 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RRP15YPR143W 753 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MUS81YDR386W 1899 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 STD1YOR047C 1335 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PEX5YDR244W 1839 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 CDC20YGL116W 1833 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 AVT5YBL089W 1380 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RIM1YCR028C-A 408 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 NSE4YDL105W 1209 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 SLU7YDR088C 1149 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RAV2YDR202C 1056 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 SLD5YDR489W 885 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 LOC1YFR001W 615 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PGD1YGL025C 1194 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YGL109WYGL109W 324 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 LIN1YHR156C 1023 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YJR020WYJR020W 333 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YKL070WYKL070W 510 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YNL109WYNL109W 546 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YNL303WYNL303W 348 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 BRX1YOL077C 876 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PFF1YBR074W 2931 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MUB1YMR100W 1863 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YBR259WYBR259W 2067 nt3.15□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 HMO1YDR174W 741 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YHL044WYHL044W 708 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YKE2YLR200W 345 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YPL107WYPL107W 747 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YBR063CYBR063C 1215 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 AGE1YDR524C 1449 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 NUR1YDL089W 1455 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YCG1YDR325W 3108 nt3.15□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 PRP8YHR165C 7242 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 TFC1YBR123C 1950 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 HFM1YGL251C 3564 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 HBT1YDL223C 3141 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YDR248CYDR248C 582 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 NSA2YER126C 786 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YGL039WYGL039W 1047 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 COX23YHR116W 456 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 ATP11YNL315C 957 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 CIK1YMR198W 1785 nt3.14□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 TOM70YNL121C 1854 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 ESC2YDR363W 1371 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 SAP1YER047C 2694 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YGR018CYGR018C 330 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 EFG1YGR271C-A 702 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 QCR10YHR001W-A 234 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YLR230WYLR230W 306 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 PDR17YNL264C 1053 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 ARL3YPL051W 597 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 TAZ1YPR140W 1146 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 SHG1YBR258C 429 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 CEP3YMR168C 1827 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 DNM1YLL001W 2274 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 MET10YFR030W 3108 nt3.13□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 GYL1YMR192W 2163 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YLR108CYLR108C 1458 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 RMT2YDR465C 1239 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 RPB9YGL070C 369 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 TAD1YGL243W 1203 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 DSE2YHR143W 978 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 ATG27YJL178C 816 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 MBB1YJL199C 327 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YLR297WYLR297W 390 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 GIM5YML094W 492 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 RCE1YMR274C 948 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 YOR152CYOR152C 771 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 snR42snR42 351 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 SHQ1YIL104C 1524 nt3.12□□□□□ -1.91
SEC39Q12745 FUS2YMR232W 2034 nt3.12□□□□□ -1.91
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