Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 PEX5YDR244W 1839 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 NSA1YGL111W 1392 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 AEP1YMR064W 1557 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 CIK1YMR198W 1785 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YCR100CYCR100C 951 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YGL218WYGL218W 651 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YGL230CYGL230C 444 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 VMA7YGR020C 357 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPL27AYHR010W 411 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 VMA10YHR039C-A 345 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ILV5YLR355C 1188 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SUB1YMR039C 879 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RCE1YMR274C 948 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YBR090CYBR090C 369 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 snR35snR35 204 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MET5YJR137C 4329 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 NFT1YKR103W 3657 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 CWH41YGL027C 2502 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ATP22YDR350C 2055 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YGL176CYGL176C 1665 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDR193WYDR193W 399 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDR209CYDR209C 414 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 NSA2YER126C 786 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 COX6YHR051W 447 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 CTK2YJL006C 972 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YJL032WYJL032W 315 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 GPX1YKL026C 504 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YML037CYML037C 1023 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 FAR3YMR052W 615 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPB8YOR224C 441 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SFG1YOR315W 1041 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 KAR4YCL055W 1008 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 DSF2YBR007C 2211 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SOK1YDR006C 2706 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDR061WYDR061W 1620 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MUB1YMR100W 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 CST9YLR394W 1449 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 DIA2YOR080W 2199 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 ATC1YDR184C 885 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YIP5YGL161C 933 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YHR212CYHR212C 336 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YIL141WYIL141W 390 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YAL066WYAL066W 309 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YLR169WYLR169W 354 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YAR060CYAR060C 336 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 NDL1YLR254C 570 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YLR366WYLR366W 306 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MER1YNL210W 813 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MPD2YOL088C 834 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 PEX34YCL056C 435 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SAG1YJR004C 1953 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 AI2Q0055 2565 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 MET6YER091C 2304 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SLP1YOR154W 1764 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 FIN1YDR130C 876 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 HTB1YDR224C 396 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPL14BYHL001W 417 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YJL169WYJL169W 369 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 LSM8YJR022W 330 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YKL070WYKL070W 510 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 PRM6YML047C 1059 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 LCL1YPL056C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 TIM12YBR091C 330 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 TAF2YCR042C 4224 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 SRP1YNL189W 1629 nt2.59□□□□□ -1.99
RPN6Q12377 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 YCL019WYCL019W 5313 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 CAF120YNL278W 3183 nt2.59□□□□□ -2
RPN6Q12377 MSH4YFL003C 2637 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 NOP56YLR197W 1515 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 UTP5YDR398W 1932 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 GTR2YGR163W 1026 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 MRPL9YGR220C 810 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 YNL203CYNL203C 612 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 RFC5YBR087W 1065 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 ESA1YOR244W 1338 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 SKO1YNL167C 1944 nt2.58□□□□□ -2
RPN6Q12377 RSM27YGR215W 333 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 GOS1YHL031C 672 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 ATG10YLL042C 504 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 RPL8BYLL045C 771 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 PDR17YNL264C 1053 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 YNL319WYNL319W 441 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 RPC40YPR110C 1008 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 NGG1YDR176W 2109 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 ESC1YMR219W 4977 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 YPL216WYPL216W 3309 nt2.57□□□□□ -2
RPN6Q12377 KHA1YJL094C 2622 nt2.56□□□□□ -2
RPN6Q12377 BCK1YJL095W 4437 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 757.9 ms