Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 PBP2YBR233W 1242 nt2.78□□□□□ -1.96
LDB17Q12342 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.78□□□□□ -1.96
LDB17Q12342 BI3Q0115 1554 nt2.78□□□□□ -1.96
LDB17Q12342 AVT5YBL089W 1380 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 UBC9YDL064W 474 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 FIN1YDR130C 876 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 PNC1YGL037C 651 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 TCD1YHR003C 1290 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 COX6YHR051W 447 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 CCE1YKL011C 1062 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GPN3YLR243W 819 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SUB1YMR039C 879 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 TPT1YOL102C 693 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GRX5YPL059W 453 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 JIP5YPR169W 1479 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 CWC22YGR278W 1734 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 VPS30YPL120W 1674 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 UTP14YML093W 2700 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 HMO1YDR174W 741 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 HTB1YDR224C 396 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGR283CYGR283C 1026 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 DLT1YMR126C 1029 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 ATG3YNR007C 933 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 PEX15YOL044W 1152 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOL114CYOL114C 609 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GRX7YBR014C 612 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 LTP1YPR073C 486 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 DPB3YBR278W 606 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 MSH4YFL003C 2637 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SLP1YOR154W 1764 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 FMN1YDR236C 657 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 COBQ0105 1158 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGL159WYGL159W 1113 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SVP26YHR181W 687 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 IKI1YHR187W 930 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOL106WYOL106W 354 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOR366WYOR366W 354 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 JSN1YJR091C 3276 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 FRE8YLR047C 2061 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YBR259WYBR259W 2067 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 ORC1YML065W 2745 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GUK1YDR454C 564 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YIL054WYIL054W 318 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SMD2YLR275W 333 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YSF3YNL138W-A 258 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SRL1YOR247W 633 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 RPS12YOR369C 432 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 CIN2YPL241C 807 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YPR203WYPR203W 309 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SWC4YGR002C 1431 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 AI3Q0060 1248 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 UPF3YGR072W 1164 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YIL174WYIL174W 228 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 CPR7YJR032W 1182 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 RPA12YJR063W 378 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 IPP1YBR011C 864 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 MCA1YOR197W 1299 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOR331CYOR331C 558 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOR387CYOR387C 621 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 UTP5YDR398W 1932 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 KIN82YCR091W 2163 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 MMS1YPR164W 4224 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 PFF1YBR074W 2931 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGL230CYGL230C 444 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GTR2YGR163W 1026 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YNL276CYNL276C 396 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YBR090CYBR090C 369 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YER138CYER138C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YER160CYER160C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YJR027WYJR027W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YML039WYML039W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YML045WYML045W 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YMR050CYMR050C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 AXL1YPR122W 3627 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 GCD2YGR083C 1956 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 SLY41YOR307C 1362 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB17Q12342 YNL011CYNL011C 1335 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 POL4YCR014C 1749 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 snR68snR68 136 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RGI1YER067W 486 nt2.71□□□□□ -1.98
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