Protein–RNA interactions for Protein: Q12161

PSH1, RING finger protein PSH1, yeastyeast

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSH1Q12161 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 GOS1YHL031C 672 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 ECM4YKR076W 1113 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 VPS63YLR261C 327 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 SWC7YLR385C 399 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YOR121CYOR121C 306 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YBR032WYBR032W 303 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 DAL5YJR152W 1632 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 SEC2YNL272C 2280 nt5.07□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 ALR2YFL050C 2577 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 MTM1YGR257C 1101 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YIL024CYIL024C 570 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YNL198CYNL198C 303 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 ARC40YBR234C 1155 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 FYV5YCL058C 459 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 TRK1YJL129C 3708 nt5.06□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 TPO5YKL174C 1857 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 POL12YBL035C 2118 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 PRP11YDL043C 801 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 BSC2YDR275W 708 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 LPP1YDR503C 825 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YGR069WYGR069W 336 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YJR038CYJR038C 363 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 NNF1YJR112W 606 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 NOP15YNL110C 663 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YOR331CYOR331C 558 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 RPS11BYBR048W 471 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 TOG1YER184C 2385 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 DIP2YLR129W 2832 nt5.05□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 APP1YNL094W 1764 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 CHA4YLR098C 1947 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YIL054WYIL054W 318 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YPR039WYPR039W 336 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 YPR096CYPR096C 303 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 CDC14YFR028C 1656 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 SPT23YKL020C 3249 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 SPC105YGL093W 2754 nt5.04□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 OLE1YGL055W 1533 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 LST4YKL176C 2487 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 OSH6YKR003W 1347 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 GNT1YOR320C 1476 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 SNF2YOR290C 5112 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 UTP11YKL099C 753 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 RPS1BYML063W 768 nt5.03□□□□□ -1.6
PSH1Q12161 CDC6YJL194W 1542 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 NUP2YLR335W 2163 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 ATP8Q0080 147 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YIL171WYIL171W 330 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YOL160WYOL160W 342 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YPL107WYPL107W 747 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YAR1YPL239W 603 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YPR059CYPR059C 387 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 HRD1YOL013C 1656 nt5.02□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YPR003CYPR003C 2265 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 Q0143Q0143 153 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 NBL1YHR199C-A 222 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YLR434CYLR434C 384 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YPL114WYPL114W 420 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 SHG1YBR258C 429 nt5.01□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YNR063WYNR063W 1824 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 BRE4YDL231C 3378 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 BFR1YOR198C 1413 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 COX4YGL187C 468 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 MRPL38YKL170W 417 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RIM9YMR063W 720 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 ATP3YBR039W 936 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt5□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 ULS1YOR191W 4860 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RPC11YDR045C 333 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RPS13YDR064W 456 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 RMT2YDR465C 1239 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 PMI40YER003C 1290 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 VOA1YGR106C 798 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YLR269CYLR269C 351 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 TMC1YOR052C 453 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 YPL276WYPL276W 438 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 PIN3YPR154W 648 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 POL4YCR014C 1749 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 VPS45YGL095C 1734 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 CDC9YDL164C 2268 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 PTR3YFR029W 2037 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 MET4YNL103W 2019 nt4.99□□□□□ -1.61
PSH1Q12161 WHI3YNL197C 1986 nt4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms