Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 CTR86YCR054C 1692 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 FRS1YLR060W 1788 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 STI1YOR027W 1770 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 DSF2YBR007C 2211 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 MCM3YEL032W 2916 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 URC2YDR520C 2319 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YDL211CYDL211C 1119 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YDR526CYDR526C 471 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RPS2YGL123W 765 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 NIT2YJL126W 924 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 SDH2YLL041C 801 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YLR458WYLR458W 381 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 MNN1YER001W 2289 nt5.5□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 GPR1YDL035C 2886 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 FRE1YLR214W 2061 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RET1YOR207C 3450 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 HMF1YER057C 390 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 EPT1YHR123W 1176 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 GAT4YIR013C 366 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 DPB3YBR278W 606 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 snR49snR49 165 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.49□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 HDA2YDR295C 2025 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 FRE3YOR381W 2136 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 IMD4YML056C 1575 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 SLX8YER116C 825 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RPL11BYGR085C 525 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RPS4BYHR203C 786 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RPL8BYLL045C 771 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 URA10YMR271C 684 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 RPL11AYPR102C 525 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 DAD3YBR233W-A 285 nt5.48□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 SEC9YGR009C 1956 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 TOS3YGL179C 1683 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 SMP3YOR149C 1551 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 SSK22YCR073C 3996 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 STN1YDR082W 1485 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YOL131WYOL131W 327 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YPL229WYPL229W 621 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YJL132WYJL132W 2253 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 YRR1YOR162C 2433 nt5.47□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 CBF5YLR175W 1452 nt5.46□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 ADE6YGR061C 4077 nt5.46□□□□□ -1.53
TFB4Q12004 IDP1YDL066W 1287 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YDR344CYDR344C 444 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 RPL30YGL030W 318 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YIL060WYIL060W 435 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 HHF2YNL030W 312 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 IST1YNL265C 897 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 SRL1YOR247W 633 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 PHO88YBR106W 567 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 UTP15YMR093W 1542 nt5.46□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 TPA1YER049W 1935 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 snR68snR68 136 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 EMI1YDR512C 564 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YGL149WYGL149W 306 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 VEL1YGL258W 621 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 STM1YLR150W 822 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 snR13snR13 124 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YML082WYML082W 1950 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 UTP13YLR222C 2454 nt5.45□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 PRP28YDR243C 1767 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 VPS52YDR484W 1926 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 BOI2YER114C 3123 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YKU70YMR284W 1809 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YTA6YPL074W 2265 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 ATO3YDR384C 828 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 CAX4YGR036C 720 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YIL012WYIL012W 342 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 RPL15AYLR029C 615 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 PPG1YNR032W 1107 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YPL039WYPL039W 951 nt5.44□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 UBP10YNL186W 2379 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 MCD1YDL003W 1701 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YDL228CYDL228C 642 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 ECT1YGR007W 972 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 SNZ2YNL333W 897 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 HUB1YNR032C-A 222 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 ATP1YBL099W 1638 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 SYO1YDL063C 1863 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 TYW1YPL207W 2433 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 NRD1YNL251C 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 MEF2YJL102W 2460 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 PUB1YNL016W 1362 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 NOP6YDL213C 678 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 CSR1YLR380W 1227 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 IRC23YOR044W 474 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 GPI10YGL142C 1851 nt5.42□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 COX26YDR119W-A 201 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YGL088WYGL088W 366 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 SIP18YMR175W 240 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 PMT4YJR143C 2289 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 BUD6YLR319C 2367 nt5.41□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 APL6YGR261C 2430 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 172.3 ms