Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBRQ0VD83 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms