Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA1Q09470 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms