Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms