Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFF3Q07654 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TFF3Q07654 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms