Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN1Q05586 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms