Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCZQ05513 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCZQ05513 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms