Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTK2Q05397 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2Q05397 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms