Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN1Q04323 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms