Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREMQ03060 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREMQ03060 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREMQ03060 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREMQ03060 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREMQ03060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREMQ03060 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREMQ03060 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREMQ03060 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREMQ03060 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms