Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP4A11Q02928 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms