Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms