Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ID3Q02535 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ID3Q02535 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ID3Q02535 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms