Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OC90Q02509 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OC90Q02509 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OC90Q02509 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OC90Q02509 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OC90Q02509 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OC90Q02509 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OC90Q02509 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms