Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XPCQ01831 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XPCQ01831 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XPCQ01831 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XPCQ01831 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XPCQ01831 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms