Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms