Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAP1Q01518 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAP1Q01518 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms