Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MS4A2Q01362 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213 ms