Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSG4Q00888 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSG4Q00888 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms