Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms