Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms