Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO1P63165 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms