Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNRPNP63162 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms