Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00313P59037 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms