Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3BP58499 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3BP58499 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms