Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2BFSP57053 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms