Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSCP56915 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSCP56915 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSCP56915 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSCP56915 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSCP56915 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSCP56915 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSCP56915 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSCP56915 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSCP56915 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSCP56915 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms