Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH8P55286 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH8P55286 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH8P55286 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH8P55286 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH8P55286 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH8P55286 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH8P55286 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH8P55286 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms