Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPP55072 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPP55072 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPP55072 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPP55072 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPP55072 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPP55072 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPP55072 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCPP55072 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCPP55072 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCPP55072 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms