Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AIF1P55008 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AIF1P55008 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AIF1P55008 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AIF1P55008 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AIF1P55008 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AIF1P55008 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AIF1P55008 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AIF1P55008 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AIF1P55008 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AIF1P55008 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AIF1P55008 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms